食品科學技術研究院主要從事農副產品保鮮、貯藏、加工的研究開發與工程技術服務，下設果蔬研究所、主食研究所、肉類研究所，擁有柑桔加工中試車間、肉類中試車間，飲料中試車間等，研究和中試設備，設施完善，掛靠有“川西平原生態大蒜（產業化）研究中心”、“四川牦牛乳技術研究開發中心”，與企業共建有5個工程技術（研究開發）中心，擁有長期工作在第一線、實踐經驗豐富的高、中級工程技術人員19人，承擔并完成多項國家部省級科研項目，獲國家、省、市科技獎10多項，出版果蔬為主的農產品加工食品專著10多部，發表論文100多篇，服務企業遍布省內外100多家，與日、韓、美及非洲多國有長期交流合作。